Jacobs nasceu na Austrália, era o sexto filho sobrevivente de John Jacobs, um publicano que emigrara de Londres c.1837, e sua esposa Sarah. Jacobs foi educado em Sydney Grammar School e na Universidade de Sydney, onde ganhou uma bolsa de estudos para clássicos, matemática e química. Ele não completou seus estudos em Sydney, mas partiu para a Inglaterra com 18 anos de idade e entrou na faculdade de St John, Cambridge, se formando com um BA em 1876, e em 1877, estudou na Universidade de Berlim.
Jacobs se casou Georgina Horne e foi pai de dois filhos e uma filha. Em 1900, aceitou o convite para se tornar editor da revisão da Enciclopédia Judaica, em Nova York, e estabeleceu-se permanentemente nos Estados Unidos, falecendo em 1916.